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Gli autori hanno sviluppato una strategia innovativa che combina l'editing genomico in situ mediato da editor di basi con un biosensore guidato da nanocorpi per identificare varianti nucleotidiche critiche, ottenendo così un record di produzione di albumina umana ricombinante in *Pichia pastoris*.
Il paper presenta CLUSTER, una nuova piattaforma bio-ortogonale basata su SNAP-tag e splicing proteico che permette l'etichettatura covalente e minimamente invasiva di proteine nelle cellule viventi tramite un piccolo peptide fluorescente da 5 kDa.
Questo studio rappresenta la prima validazione preclinica multicentrica di cellule CAR T che sovraesprimono CCR8, dimostrando la fattibilità di una strategia armonizzata e riproducibile per confermare l'efficacia di queste terapie contro i tumori solidi e facilitare la loro traduzione clinica.
Questo articolo presenta una dimostrazione geometrica basata sul teorema del punto fisso di Brouwer e un'analisi di raggiungibilità basata su intervalli per provare l'esistenza e localizzare rigorosamente i cicli limite in una classe di oscillatori biomolecolari.
Questo studio utilizza uno screening sistematico CRISPRi per identificare 31 geni nel metabolismo centrale dell'*E. coli* la cui repressione modula la produzione di licopene, rivelando nuovi bersagli genetici per ottimizzare la resa dei prodotti naturali ad alto valore.
Questo studio quantifica sistematicamente il destino delle proteine eterologhe in *Synechocystis* sp. PCC 6803, rivelando che quasi la metà subisce una significativa degradazione e dimostrando che la sostituzione degli enzimi con omologhi è spesso più efficace dell'ottimizzazione degli elementi genetici per migliorare la produzione di composti nelle cellule fotosintetiche.
Il paper propone AncestorGFN, un approccio innovativo basato sulle Generative Flow Networks che permette di generare sequenze biologiche e inferire relazioni filogenetiche senza l'uso di allineamenti multipli, dimostrando la capacità di catturare pattern evolutivi e progettare nuove sequenze.
Il paper introduce SIRIUS, un algoritmo di ottimizzazione combinatoria basato sulla programmazione lineare intera che genera sequenze di DNA sinonime massimamente divergenti per una data proteina, migliorando la stabilità dei costrutti sintetici rispetto ai metodi esistenti.
Gli autori hanno sviluppato un framework predittivo chiamato YeIP che, mappando sistematicamente l'effetto della posizione cromosomica sull'espressione genica nel lievito, permette di ottimizzare razionalmente le vie metaboliche selezionando strategicamente i siti di integrazione genomica senza modificare promotori o copie geniche.
Questo articolo presenta un flusso di lavoro automatizzato che integra strumenti di elaborazione del linguaggio naturale e modelli linguistici di grandi dimensioni per estrarre interazioni biomolecolari dalla letteratura scientifica e costruire un grafo della conoscenza strutturato che supporta la progettazione di recettori CAR di nuova generazione.
Questo studio presenta InfinMark, un framework di steganografia del DNA bimodale end-to-end che integra IoT e DNA-of-Things per realizzare un sistema completo di anti-contraffazione basato su nanoparticelle informative, capace di garantire la tracciabilità e l'autenticazione rapida dei prodotti dalla produzione al consumo.
Questo studio introduce i "protonuclei" a DNA come mimetici nucleari programmabili per dimostrare che l'ambiente confinato e multivalente influenza drasticamente la separazione di fase della proteina FUS, rivelando limiti degli assay tradizionali e offrendo un nuovo strumento per studiare le transizioni patologiche liquido-solido in condizioni controllate.
Questo studio presenta un quadro di controllo feedback multiscala guidato da modelli che utilizza strategie di guadagno schedulato per migliorare il rigetto dei disturbi nelle colture batteriche in batch, adattando dinamicamente i parametri del controllore alle variazioni dello stato fisiologico cellulare durante le diverse fasi di crescita.
Lo studio dimostra che la sostituzione endogena del gene *rpb9* del lievito fissionario con l'omologo umano *POLR2I* rivela sia funzioni conservate, come la crescita e la risposta allo stress, sia ruoli nuovi nella formazione dell'eterocromatina e nella chemioresistenza, pur evidenziando differenze specifiche nella resistenza agli inibitori della trascrizione.
Questo articolo presenta SurPhACE, una piattaforma di ingegneria sintetica che combina la display superficiale su *E. coli* e la display fagica con il microvirus {Phi}X174 per un'evoluzione continua ad altissimo throughput, permettendo l'ottimizzazione e la generazione di nuovi nanocorpi in sistemi procariotici senza la necessità di librerie di screening tradizionali.
Gli autori hanno ottimizzato la variante LightR-Src modificando i domini VVD e il linker per creare due nuovi interruttori allosterici fotosensibili che offrono un controllo temporale rapido e reversibile o un'attivazione sostenuta dell'attività della chinasi Src, ampliando così la versatilità degli strumenti optogenetici per lo studio dei segnali cellulari.
Questo studio utilizza la PCR quantitativa per analizzare globalmente le reazioni di legatura a livello di singolo nick nelle nanostrutture di DNA, rivelando che l'efficienza di legatura dipende dalla probabilità di attracco dell'enzima e può essere uniformata modificando le condizioni di reazione con un co-solvente DMSO.
Gli autori hanno sviluppato CRISPR-MACE, una piattaforma che utilizza la pressione selettiva mediata da proteine anti-CRISPR per guidare l'evoluzione continua di varianti di Cas9 direttamente nelle cellule umane, ottenendo mutanti con capacità di legame al DNA modificata e una resistenza quasi totale all'inibitore AcrIIA4.
Il documento presenta MATCH, un metodo biochimico modulare che permette di ingegnerizzare il tropismo degli adenovirus associati (AAV) mediante coniugazione covalente sito-specifica di proteine di targeting, consentendo un trasduzione efficiente e programmata di cellule specifiche come i linfociti T umani e un potenziato attraversamento della barriera emato-encefalica per applicazioni terapeutiche.
Questo studio sviluppa modelli matematici e un'analisi di sensibilità per i recettori synNotch-CAR T, identificando parametri chiave come l'associazione del ligando e la forza del promotore come bersagli ingegneristici fondamentali per ottimizzare la dinamica e la sintonizzabilità delle terapie tumorali.